Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM1Q8TC05 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDM1Q8TC05 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms