Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CFAP61Q8NHU2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP61Q8NHU2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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