Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATL2Q8NHH9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms