Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA6DQ8NFY4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6DQ8NFY4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms