Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHDC9Q8NEP7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHDC9Q8NEP7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms