Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NGDNQ8NEJ9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NGDNQ8NEJ9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NGDNQ8NEJ9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NGDNQ8NEJ9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NGDNQ8NEJ9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NGDNQ8NEJ9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms