Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPRYD3Q8NCJ5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPRYD3Q8NCJ5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms