Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MFSD2AQ8NA29 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms