Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9N7

LRRC57, Leucine-rich repeat-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC57Q8N9N7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC57Q8N9N7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC57Q8N9N7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms