Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC33Q8N5R6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms