Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4U5

TCP11L2, T-complex protein 11-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L2Q8N4U5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TCP11L2Q8N4U5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TCP11L2Q8N4U5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TCP11L2Q8N4U5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TCP11L2Q8N4U5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TCP11L2Q8N4U5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms