Protein–RNA interactions for Protein: Q8N431

RASGEF1C, Ras-GEF domain-containing family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1CQ8N431 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RASGEF1CQ8N431 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGEF1CQ8N431 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms