Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHTF2Q8N3S3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHTF2Q8N3S3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHTF2Q8N3S3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF2Q8N3S3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF2Q8N3S3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF2Q8N3S3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF2Q8N3S3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF2Q8N3S3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF2Q8N3S3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF2Q8N3S3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHTF2Q8N3S3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms