Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE1Q8N0S2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE1Q8N0S2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE1Q8N0S2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE1Q8N0S2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE1Q8N0S2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE1Q8N0S2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE1Q8N0S2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE1Q8N0S2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE1Q8N0S2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYCE1Q8N0S2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCE1Q8N0S2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms