Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
N4BP2Q86UW6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
N4BP2Q86UW6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
N4BP2Q86UW6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP2Q86UW6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP2Q86UW6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP2Q86UW6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP2Q86UW6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP2Q86UW6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP2Q86UW6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP2Q86UW6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP2Q86UW6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP2Q86UW6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP2Q86UW6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP2Q86UW6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP2Q86UW6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP2Q86UW6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP2Q86UW6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
N4BP2Q86UW6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms