Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC3Q7Z5M5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC3Q7Z5M5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms