Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SSX7Q7RTT5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSX7Q7RTT5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms