Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SSH2Q76I76 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SSH2Q76I76 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SSH2Q76I76 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms