Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms