Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP31Q70CQ4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
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USP31Q70CQ4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
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USP31Q70CQ4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP31Q70CQ4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
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