Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYDE1Q6ZW31 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYDE1Q6ZW31 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms