Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP26C1Q6V0L0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP26C1Q6V0L0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms