Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALKAL1Q6UXT8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALKAL1Q6UXT8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALKAL1Q6UXT8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ALKAL1Q6UXT8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALKAL1Q6UXT8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALKAL1Q6UXT8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALKAL1Q6UXT8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALKAL1Q6UXT8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALKAL1Q6UXT8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALKAL1Q6UXT8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALKAL1Q6UXT8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms