Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CASP12Q6UXS9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CASP12Q6UXS9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms