Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VSTM1Q6UX27 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VSTM1Q6UX27 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms