Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTR9Q6PD62 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTR9Q6PD62 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms