Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RFWD3Q6PCD5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD3Q6PCD5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms