Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCSD1Q6JBY9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms