Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SFRP4Q6FHJ7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFRP4Q6FHJ7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms