Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CARMIL2Q6F5E8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CARMIL2Q6F5E8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms