Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO4Q6EEV6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SUMO4Q6EEV6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms