Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ANKRD40Q6AI12 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD40Q6AI12 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms