Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CHIC1Q5VXU3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms