Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF38BQ5VTL8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms