Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIE3

VWA5B1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B1Q5TIE3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VWA5B1Q5TIE3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VWA5B1Q5TIE3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VWA5B1Q5TIE3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VWA5B1Q5TIE3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VWA5B1Q5TIE3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VWA5B1Q5TIE3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VWA5B1Q5TIE3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VWA5B1Q5TIE3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VWA5B1Q5TIE3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VWA5B1Q5TIE3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VWA5B1Q5TIE3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VWA5B1Q5TIE3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VWA5B1Q5TIE3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VWA5B1Q5TIE3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VWA5B1Q5TIE3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VWA5B1Q5TIE3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VWA5B1Q5TIE3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms