Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3LQ5T215 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms