Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HIVEP3Q5T1R4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HIVEP3Q5T1R4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms