Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC122Q5T0U0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC122Q5T0U0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms