Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH8Q5T0T0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms