Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NHSL1Q5SYE7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NHSL1Q5SYE7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms