Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FRMPD1Q5SYB0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
FRMPD1Q5SYB0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FRMPD1Q5SYB0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms