Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRMS1LQ5PSV4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms