Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COLEC12Q5KU26 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms