Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM47AQ5JRC9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM47AQ5JRC9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms