Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9R7

PPP6R3, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6R3Q5H9R7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP6R3Q5H9R7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP6R3Q5H9R7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP6R3Q5H9R7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP6R3Q5H9R7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP6R3Q5H9R7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP6R3Q5H9R7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP6R3Q5H9R7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP6R3Q5H9R7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP6R3Q5H9R7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP6R3Q5H9R7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP6R3Q5H9R7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP6R3Q5H9R7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms