Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR3Q5GH77 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms