Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF6Q58WW2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms