Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COBLL1Q53SF7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms