Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FNDC1Q4ZHG4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FNDC1Q4ZHG4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms