Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GREB1Q4ZG55 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms